Afin de mieux contrôler militairement le Sud de la France, Vauban se voit confier la charge de la construction des nombreuses places fortes. Toute la région va alors se couvrir de citadelles d'importance variée. Le site de Mont-Louis sera choisi comme pivot central du réseau de fortifications construits le long des Pyrénées pour différentes raisons expliquées sur la page d'histoire de Mont-Louis.
Latour de Carol sera également renforcé, mais ses efforts porteront surtout sur des emplacements stratégiques : il fait relever les remparts de Villefranche-de-Conflent et dote la ville d'une citadelle protectrice sur les hauteurs, le fort Libéria. Puis Prats-de-Mollo est également renforcé d'une deuxième citadelle, le fort Lagarde, ainsi que le col du Perthus avec le fort Bellegarde.
Les remparts de Perpignan sont modifiés, ainsi que le Castillet, et enfin le fort de Salses subira un abaissement de près de 15 m de hauteur afin de le camoufler un peu plus des regards de l'éventuel ennemi.
Cette période durant laquelle Vauban viendra dans la région aura pour effet de modifier radicalement le système de défense roussillonnais, désormais plus apte à contrer l'envahissant voisin espagnol. Comme on le verra plus loin, ce ne fut pas fait en pure perte.
Les Pyrénées-Orientales