Histoire
Situé dans la vallée de la Têt assez haut en montagne, Fontpédrouse a profité des bénéfices des échanges entre Cerdagne et Roussillon, mais il a également subit les inconvénients qui sont inévitables dans une telle situation. Le site est probablement préhistorique puisque des traces d'activité humaine ont été repéré en Cerdagne mais aussi régulièrement en Conflent. On peut donc penser que la région était l'un des terrains de chasse de nos lointains ancêtres au même titre que la région d'Eyne par exemple.
A l'ère romaine des grands travaux de désenclavements des régions ont vu le jour. La Via Confluentana était une route qui prolongeait la Via Domitia (Beaucaire-le Perthus), elle même se transformant en Via Cerdana lorsqu'elle arrivait sur le plateau cerdan. Le village est probablement né d'une station construite par les romains sur cette voie pour le repos des voyageurs, et cela avant la station suivante, La Cabanasse.
Durant le Moyen-âge le village relevait de la vicomté de Conflent, créé par Charlemagne en même temps que l'ensemble des autres comtés. C'est à cette époque que fut construit un château destiné à protéger les habitants de la vallée, habitants qui se sont peu à peu regroupés sous ses remparts pour assurer leur protection. Nous sommes alors au IXe et Xe siècle. L'histoire de Fontpédrouse jusqu'au XIIIe siècle m'est inconnu. Il parait logique que la seigneurie appartenait à une famille laïque, voire un ordre religieux.
Durant le XIIIe siècle, les rois de Majorque dirigent le Haut Conflent. Jacques 1er protège son territoire en créant un réseau de tours de surveillance dont Fontpédrouse bénéficiera sans en faire partie. La tour haute est à Fedges, elle même reliée à celle de La Llagonne, et la tour basse est celle d'Olette. Ainsi encadré le village fut alerté à temps en cas d'attaques. L'opposition de la coalition Castille-Aragon avec la France a provoqué de nombreuses guerres dans le Conflent. Fontpédrouse eu de la chance car le village est situé trop loin dans la vallée pour vraiment constituer un enjeu. Il s'est contenté de voir passer les armées sans trop avoir à souffrir de leur passage.
Le XVIIe siècle a également été une période néfaste pour les habitants du Conflent. La guerre de 30 ans entre l'Espagne et la France à provoqué le passage des armées, armées qui repasseront en 1793 dans les deux sens ! Entre temps le traité des Pyrénées a séparé la Catalogne en deux. Le Conflent redevient français, et le roi taxe les catalans du Nord de la gabelle, un impôt sur le sel. A la suite du Vallespir, le Conflent entre en rébellion contre les gabelous, mais cette histoire se terminera dans le sang des révoltés. Fontpédrouse n'est pas trop touché là aussi par la répression française qui y fait suite.
La commune de Prats Balaguer Saint-Thomas est rattachée à celle de Fontpédrouse en 1822. Après la construction au début du siècle d'un bâtiment fermé, toutes les installations thermales ont été refaites en 1993. Il y a à présent trois bassins dont les eaux proviennent directement de la montagne. Le seul traitement qui y est fait est un mélange avec de l'eau refroidit, tout ça pour conserver une température de 36° et pas plus ! En 2001, un centre de soins à vu le jour juste à côté des bassins.